Sebuah tim ilmiah sudah berbagi metode baru buat membedakan antara sel punca yg sehat dan sel progenitor – dan apakah sel tadi bersifat kanker atau sehat – berasal sampel pasien menggunakan leukemia myeloid akut (AML), penyakit yang ditimbulkan sang adanya sel punca darah ganas yang historis sulit buat diidentifikasi. Temuan yg diterbitkan hari ini pada jurnal Cell Stem Cell membuka jalan bagi pengembangan teknik baru buat memprediksi apakah pasien akan merespons kemoterapi.
AML artinya jenis kanker yang ditandai dengan pertumbuhan cepat dan akumulasi sel darah putih abnormal. Penyakit ini diduga berkembang ketika sel punca darah, yg sebagai semua jenis sel darah lainnya, tak matang dengan baik. pada proses ini, sel punca darah sangat relevan karena memunculkan sel progenitor dan diyakini bahwa di pada sel inilah mutasi leukemia terjadi. tampaknya sel punca leukemia bertahan asal kemoterapi, yg akan mengungkapkan tingginya tingkat kekambuhan di AML dan penyebab kematian pasien yang tak jarang terjadi.
memahami bagaimana sel induk memunculkan sel progenitor dalam darah dalam konteks AML sangat krusial buat mempertinggi pemahaman kita wacana penyakit ini, mengembangkan indera diagnostik dan prognostik yang lebih baik, serta mengidentifikasi pengobatan baru dan target terapi. namun, ini secara historis sulit sebab tingkat variabilitas yang tinggi pada antara pasien.
“sampai ketika ini, upaya buat memahami bagaimana sel punca leukemia serta sel progenitor berdiferensiasi pada AML cukup berhasil. Ini sebab ekspresi gen sangat tak normal di penyakit ini”, tegas Sergi Beneyto, penulis pertama artikel dan mahasiswa doktoral dalam grup Dr. Lars Velten di Center for Genomic Regulation (CRG).
Penulis menjawab tantangan ini dengan membentuk CloneTracer, sebuah metode komputasi yg menggunakan pengurutan sel tunggal, sebuah teknik yg mengukur aktualisasi diri gen pada ribuan sel di saat yang bersamaan. Mereka menerapkan CloneTracer ke data, yg bekerja pada resolusi klonal, yang berarti bisa mengikuti evolusi tumor menggunakan melacak bagaimana sel individu memperoleh mutasi saat timbul.
CloneTracer dipergunakan buat menganalisis data berasal sampel sumsum tulang asal 19 pasien, menyampaikan dua kompartemen sel punca yang tidak sinkron; kumpulan sel punca yg sebagian besar sehat, serta kompartemen lain yang sangat aktif yang sebagian akbar terdiri berasal sel punca leukemia.
CloneTracer pula menyampaikan bahwa mutasi, termasuk tujuh dari sepuluh gen driver AML yang paling acapkali bermutasi, hanya menyampaikan efeknya di sel progenitor. karakteristik yg diamati (fenotipe) asal sel-sel progenitor berkorelasi menggunakan respon pasien terhadap terapi.
Temuan ini berimplikasi pada prognosis serta pengobatan AML karena sel-sel progenitor yang telah berdiferensiasi menjadi stadium dewasa merespons terapi dengan lebih baik. “Begitu sel leukemia mulai berdiferensiasi sebagai nenek moyang, beliau sebagai gila dan menjadi sangat tidak sama berasal sel nenek moyang yg sehat. menggunakan melihat orang tua perempuan , kita dapat memperkirakan secara wajar apakah kemoterapi lini pertama akan berhasil. Kami kini bekerja untuk memvalidasi ini dalam kohort yang lebih besar dan membentuk uji klinis buat jenis sel ini, ”kata Dr. Anne Kathrin Merbach, rekan penulis studi dan peneliti pascadoktoral pada gerombolan Profesor Carsten Müller-Tidow pada tempat tinggal Sakit Universitas asal Heidelberg .
galat satu keterbatasan CloneTracer adalah pengurutan RNA sel tunggal mahal, memakan saat, serta tidak layak buat dipergunakan di klinik. buat mengatasi kendala ini, tim berencana buat berbagi cara mengkarakterisasi sel progenitor untuk memprediksi respons terhadap kemoterapi menggunakan FACS (penyortiran sel aktif fluoresensi), teknik awam yg digunakan dalam penelitian leukemia dan tersedia pada sebagian besar departemen hematologi.
Penulis penelitian mengakui bahwa kecuali terapi jua menargetkan deretan sel punca leukemia yg sebenarnya, imbas di kekambuhan serta kelangsungan hidup jangka panjang terbatas. Resolusi klon yg ditawarkan oleh CloneTracer memungkinkan penulis buat mengkarakterisasi indikasi tangan aktualisasi diri gen berasal populasi sel kritis ini, yang tidak merespons kemoterapi lini pertama dengan baik. Mereka memperingatkan bahwa sampel yg lebih akbar akan diperlukan untuk memvalidasi temuan mereka sebelum dapat membentuk terapi yg lebih baik.
Studi ini adalah kolaborasi bersama antara Barcelona Center for Genomic Regulation dan Departemen Kedokteran pada Universitas Heidelberg di Jerman. Itu didanai oleh Kementerian Pendidikan dan Penelitian Federal Jerman, Kementerian Sains, penemuan dan Universitas Spanyol, Yayasan Penelitian Jerman, bantuan Kanker Jerman serta Kolektif Emerson.
