Sebuah tim peneliti Andalusia dengan anggota dari Universitas Córdoba (UCO) serta Institut Pertanian Berkelanjutan (IAS-CSIC) , Platform buat Genomics serta Bioinformatika Andalusia dan perusahaan Ficus Biotechnology (Turki) telah mengurutkan genom buat pertama kalinya asal varietas zaitun Ayvalik. Secara khusus, para ilmuwan menganalisis DNA spesies ini serta Picual ( Olea europaea ) buat mengidentifikasi gen yang terkait dengan karakteristik yg menarik di pohon ini, mirip fisik dan nutrisi. dengan akibat tersebut, petani bisa melakukan persilangan buat mendapatkan tumbuhan yang lebih tahan terhadap penyakit dan mengatur masalah seperti berukuran atau rasa buah zaitun.
dalam artikel ‘Eksplorasi genom-luas gen biosintesis minyak pada varietas pohon zaitun yg dibudidayakan (Olea europaea): wawasan ihwal regulasi biosintesis minyak’ yang diterbitkan pada Functional & Integrative Genomics , para ilmuwan menjelaskan bahwa analisis tersebut berfokus di varietas Picual serta Ayvalik buat menjadi yg paling awam dibudidayakan di Spanyol dan Turki, masing-masing, negara-negara yg berpartisipasi pada penelitian ini. Selanjutnya, ini artinya yg pertama menerbitkan urutan lengkap Ayvalik, yg memiliki 69.028 gen, tidak seperti varietas Picual, dengan 55.073 gen.
pada studi tadi, para ahli menyebutkan bahwa setiap sel organisme mengandung DNA, sebuah molekul menggunakan tampilan heliks ganda dan , bersama-sama, ia menghasilkan genom. Ini berisi sebagian besar materi genetik makhluk hayati yg menjadi miliknya, mirip kode komputer menggunakan isu yang menghasilkan program mengekspresikan ciri tertentu dan melakukan fungsi tertentu. pada masalah pohon zaitun, contohnya, gen memilih bahwa pohon membuat butir pada waktu eksklusif pada setahun atau mengandung kualitas nutrisi eksklusif.
mengidentifikasi gen
buat mempersiapkan penelitian ini, kelompok peneliti memakai teknik analisis yg termasuk pada disiplin genomik struktural, yang menyelidiki urutan basa asam nukleat seolah-olah mereka artinya kerangka sebuah bangunan; serta RNA melalui genomik fungsional, yang bertujuan buat menghubungkan urutan gen dengan fungsi biologis. Secara spesifik, mereka menggunakan data yg diperoleh berasal DNA pohon zaitun buat menulis semacam kamus. “di dalamnya, kami menggambarkan fungsi apa yang dimiliki setiap gen dan bagaimana mereka berinteraksi satu sama lain. menggunakan cara ini, kita dapat tahu mengapa setiap pohon mirip itu dan mengapa beliau mengekspresikan karakteristik eksklusif” jelas Gabriel Dorado Pérez , seorang peneliti asal Universitas Córdoba, kepada Discover Foundation .
buat mengurutkan atau “membaca” genom, kelompok penelitian pertama-tama mengumpulkan jaringan asal daun serta butir varietas Ayvalik dan Picual buat mendapatkan DNA serta RNA masing-masing. sehabis sampel diperoleh serta materi genetiknya diisolasi, mereka mengurutkan dan merakitnya seolah-olah itu adalah garis kitab . Selanjutnya, mereka mengidentifikasi setiap gen serta menentukan fungsi apa yang diberikan masing-masing gen tadi. contohnya, mereka memilih diantaranya yg terlibat pada pertumbuhan pohon, kandungan nutrisi, dan produksi buah awal.
Jenis analisis buat membaca genom ini memungkinkan pengembangan tes seperti yg berdasarkan di reaksi berantai polimerase (PCR), yang memungkinkan urutan asam nukleat DNA dan RNA buat diamplifikasi in vitro. Teknik-teknik ini akan bertindak sebagai kaca pembesar yang memungkinkan organisme buat diidentifikasi serta persilangan yg diinginkan didesain hanya dalam beberapa bulan, waktu tahun-tahun sebelumnya dibutuhkan percobaan dan kesalahan.
dengan cara ini, peneliti dapat menyilangkan spesimen yang diinginkan dan mendapatkan tumbuhan yang diubahsuaikan dengan kebutuhan petani. misalnya, Jika dia ingin membentuk zaitun awal, dia bisa menanam pohon zaitun dengan ciri ini. “Selanjutnya, menggunakan pengurutan genom, kami bisa mengidentifikasi pohon yg mengandung senyawa nutrisi yg menarik pada bidang makanan serta farmasi,” tambah peneliti Gabriel Dorado Pérez.
saat ini, para peneliti berasal kelompok ‘Agrifood Biotechnology’ (AGR-248) memfokuskan pekerjaan mereka di penerapan studi genomik struktural dan fungsional ini. “Kami sedang mengerjakan desain metode sesuai hayati molekuler serta ketertelusuran buat melindungi denominasi dari, mengesahkan kualitas, serta mencegah penipuan dalam produk yg asal dari pohon zaitun,” tambah Gabriel Dorado Pérez.
Studi ini dibiayai oleh Kementerian Sains dan penemuan (MICINN) dan Institut Nasional buat Riset dan Teknologi Pertanian dan Pangan (INIA). Demikian pula, beliau memiliki dana asal Kementerian Pertanian, Perikanan serta Pangan, Kementerian Transformasi Ekonomi, Industri, Pengetahuan dan Universitas (Junta de Andalucía) serta dana sendiri asal Universitas Córdoba. Pekerjaan ini artinya bagian dari International Olive Genome Consortium (IOGC).
