Proyek BioGenome Bumi , yang bertujuan untuk mengurutkan genom semua spesies tanaman, hewan, jamur, dan kehidupan mikroba di Bumi, memasuki produksi skala besar. Keadaan penelitian dan tantangan proyek selanjutnya telah dipresentasikan dalam jurnal PNAS dalam serangkaian artikel yang diterbitkan oleh para ilmuwan dari berbagai institusi, termasuk UAB.
Proyek BioGenome Bumi (EBP) , dimulai pada November 2018, adalah salah satu proyek ilmiah terpenting saat ini. Tujuannya adalah untuk menyediakan katalog lengkap sekuens DNA untuk 1,8 juta spesies tumbuhan, hewan, dan jamur, serta eukariota bersel tunggal.
Bumi diproyeksikan akan kehilangan 50% keanekaragaman hayatinya pada akhir abad ini jika tidak ada tindakan yang diambil untuk mengekang perubahan iklim dan melindungi kesehatan ekosistem worldwide. Membuat perpustakaan digital sekuens DNA untuk semua kehidupan eukariotik yang diketahui dapat membantu menghasilkan alat yang efektif untuk mencegah hilangnya keanekaragaman hayati dan penyebaran patogen, memantau dan melindungi ekosistem, serta meningkatkan layanan ekosistem.
Setelah fase percontohan, proyek memasuki tahap produksi skala besar. reputation penelitian telah dipresentasikan dalam kumpulan artikel yang diterbitkan dalam jurnal ilmiah national Academy of Sciences AS, complaints of the national Academies of science . Teks-teks tersebut menjelaskan tujuan, pencapaian hingga saat ini dan langkah-langkah EBP selanjutnya.
“Artikel-artikel ini menangkap esensi dan kegembiraan dari apa yang merupakan upaya terkoordinasi skala terbesar dalam sejarah biologi,” kata Harris Lewin, presiden EBP dan profesor evolusi dan ekologi di university of California, Davis.(UC Davis) .
Setelah fase inisiasi, tujuan fase 1, hingga 2023, adalah menghasilkan genom referensi yang mewakili sekitar nine.four hundred famili taksonomi. Sejauh ini, proyek terafiliasi telah menghasilkan sekitar 200 genom ini, dengan pengurutan, perakitan, dan anotasi lebih dari 3.000 diharapkan akan selesai pada akhir 2022, mewakili sekitar sepertiga dari tujuan Fase 1.
Urutan DNA dari genom dapat diterapkan “dalam berbagai tantangan international yang mendesak, seperti mencegah hilangnya keanekaragaman hayati dan mengadaptasi tanaman pangan terhadap perubahan iklim.” “Kemajuan EBP dalam mengurutkan kehidupan eukariotik sangat rendah hati dan menginspirasi: mencapai tujuan akhir dari mengurutkan semua kehidupan eukariotik sekarang tampaknya dalam jangkauan,” Lewin menyimpulkan.
Cristina Roquet , peneliti pascadoktoral di UAB di Departemen Biologi Hewan, Biologi dan Ekologi Tumbuhan (BABVE) dan kolaborator di Laboratoire de Ecologie Alpine, berpartisipasi dalam artikel pengantar koleksi yang diterbitkan di PNAS . “Proyek seperti EBP menunjukkan bahwa kolaborasi ilmiah merupakan syarat penting untuk mencapai tantangan besar yang ditimbulkan oleh darurat iklim saat ini,” kata peneliti.
Partisipasi Catalan di EBP
EBP berfungsi sebagai jaringan jaringan internasional, mengoordinasikan berbagai upaya khusus takson atau nearby dan nasional, seperti Proyek Genom Vertebrata, Proyek Pohon Kehidupan Darwin (Inggris Raya dan Irlandia), dan Atlas Genom Referensi Eropa (Eropa) . . Ia memiliki 5.000 ilmuwan dan staf teknis dari forty four lembaga anggota di 22 negara di semua benua kecuali Antartika dan memiliki 49 proyek afiliasi.
Salah satu simpul pertama dari jaringan ini, yang didirikan pada 2019, adalah Inisiatif Catalan untuk Proyek Biogenom Bumi (CBP) , yang dipromosikan oleh Institute of Catalan research (IEC) dan dua anak perusahaannya: Catalan Society of Biology (SCB) dan Catalan group of natural records (ICHN) dan Andorra research + Innovation, menyatukan dua puluh institusi dan lebih dari seratus ilmuwan.
Tujuan dari CBP adalah untuk menghasilkan katalog rinci genom spesies eukariotik dari wilayah bahasa dan budaya Catalan. Saat ini, tim sedang mengurutkan sekitar lima puluh genom, yang pertama, dari Balearic Shearwater, telah selesai. Montserrat Corominas, seorang peneliti di Universitas Barcelona dan koordinator CBP, mengemukakan bahwa “tantangan berikutnya bagi CBP adalah mendapatkan pembiayaan untuk mempercepat fase produksi proyek dan membukanya bagi seluruh masyarakat.”
Kontribusi UAB dalam CBP
Kontribusi UAB untuk CBP telah dimulai sejak awal melalui Profesor Jordina Belmonte , peneliti di BABVE dan ICTA-UAB dan presiden ICHN. Dan juga melalui Cristina Roquet , yang telah berbagi pengalaman penelitiannya dalam mengurutkan genom tanaman alpine dalam kegiatan yang diselenggarakan oleh CBP.
“Proyek CBP terbuka untuk semua peneliti keanekaragaman hayati dan genomik di UAB,” kata Jordina Belmonte , yang menyoroti pentingnya “semua bekerja secara kolaboratif dan mengikuti standar international, yang memungkinkan kami mencapai tantangan worldwide untuk mengurutkan semua keanekaragaman eukariotik di planet ini”.
