Sebuah karya oleh para ilmuwan Xavier Salvatella dan Modesto Orozco di IRB Barcelona mengungkapkan keberadaan jalan raya informasi yang menghubungkan dan menghubungkan titik-titik jauh dalam protein yang sama.
Diterbitkan di Nature Communications , makalah ini mendorong bidang teoritis kunci untuk penemuan obat, karena akan memungkinkan untuk menemukan lebih banyak lagi titik jangkar obat dalam protein yang menarik secara biomedis.
Protein adalah rantai asam amino yang, dilipat menurut pola struktural tertentu dan juga tidak dilipat, menjalankan fungsi di dalam sel. Proteiin menerima sinyal yang diteruskan dari satu ke yang berikutnya dan yang dasar untuk kehidupan. Tetapi di dalam protein tertentu, apakah ada “jalan raya” yang dilalui sinyal, seperti lomba lari estafet? Yaitu, bagaimana informasi ditransfer dalam protein tertentu? “Ini adalah salah satu pertanyaan kunci dalam biofisika,” kata Xavier Salvatella , Profesor Riset ICREA di Institut Penelitian Biomedis (IRB Barcelona) dan kepala laboratorium Biofisika Molekuler .
Karya terbaru di bidang ini, diterbitkan dalam edisi online lanjutan oleh Nature Communications , bekerja sama dengan Modesto Orozco juga di IRB Barcelona, seorang ahli dalam simulasi biokomputasi , menunjukkan bahwa transmisi informasi jarak jauh di dalam protein ada, itu dapat diamati dan mereka menunjukkan ini untuk semua protein yang mengandung lembaran beta, salah satu dari dua pola struktural yang diadopsi oleh protein terlipat.
“Kami menemukan jalur transmisi informasi di dalam proteiin dan konsep yang telah kami validasi untuk jenis protein ini memungkinkan kami untuk berspekulasi bahwa di dalam protein ada banyak permukaan valid lainnya di mana obat dapat berinteraksi,” Salvatella menjelaskan .
Tim peneliti telah menemukan bagaimana bagian-bagian yang berbeda dari protein berkorelasi bahkan ketika mereka secara fisik berjauhan. “Dalam protein, hal yang sama terjadi seperti dalam koreografi dengan penari, di mana gerakan para anggota terhubung bahkan ketika mereka jauh. Jika yang pertama mengangkat tangan, yang terakhir juga ”, menggambarkan peneliti.
Tambang untuk penemuan obat
Obat bekerja pada situs tertentu atau domain aktif dari protein target untuk penyakit tertentu. Pada sebagian besar penyakit menular dan kanker, salah satu masalahnya adalah titik kerja obat berevolusi dan bermutasi, dan obat tidak lagi efisien.
Konsep yang sekarang divalidasi oleh peneliti IRB Barcelona membuat kita berpikir bahwa titik di mana obat itu pergi sama validnya dengan titik lain dalam rantai transmisi informasi. “Jika demikian – yang semuanya menunjukkan itu – kita akan dapat menemukan banyak tempat lain dalam struktur proteiin di mana itu akan sama atau lebih efisien untuk bersyafaat dengan obat. Poin yang meskipun jauh dari tempat kunci atau fungsional protein akan memiliki efek yang sama”, alasan Salvatella .
Peneliti menjelaskan bahwa sudah ada banyak obat yang bekerja pada titik-titik yang bukan merupakan situs aktif tetapi ditemukan secara kebetulan, dengan penyaringan molekul besar – besaran dan setelah melihat bahwa mereka bergabung di tempat yang tidak terduga. “Sistem ini jelas tidak efisien. Kita harus bisa mensistematisasikannya dan jika berhasil, kita akan memiliki cara yang sangat ampuh untuk menemukan narkoba”, ujar peneliti.
Selain mendorong bidang konseptual, Salvatella bekerja dengan proteiin kepentingan biomedis. “Kami sudah cukup tahu untuk mencari jalur protein terkait penyakit secara paralel, dan jika kami berhasil, kami akan menemukan tambang untuk penemuan obat,” katanya.
Penulis pertama artikel ini adalah peneliti postdoctoral Bryn Fenwick dari kelompok Xavier Salvatella , saat ini di Scripps Institute di California, dan Laura Orellana dari kelompok Modesto Orozco , hari ini di Science for Life Laboratory , Royal Institute of Technology , di Stockholm.
Sumber : http://biotech-spain.com/es/articles/la-transmisi%C3%B3n-de-informaci%C3%B3n-a-trav%C3%A9s-de-prote%C3%ADnas-podr%C3%ADa-revolucionar-el-descubrimiento-de-f%C3%A1rmacos/
